Церковь Святой Великомученницы Варвары – единственный в Пскове сохранившийся памятник деревянного зодчества XVII в.
В XIV-XV вв. здесь был Варваринский монастырь, но в 1561 г. женский монастырь сгорел во время пожара.
Церковь, дошедшая до нас, построена в 1618 г. Выстроена она по типу самых древних сельских церквей.
В 1786 г. Варваринский храм был приписан к церкви Покрова от Нового Торга. Церковь не отапливалась, поэтому богослужения в ней совершались 4 (17) декабря и с Пасхи до Покрова. На деревянной колокольни находились 4 колокола.
В советские годы церковь была закрыта, а её здание передано музею. В 90-е годы церковь Святой Великомученницы Варвары возвращена Псковской епархии. В ноябре 2002 г. настоятелем церкви был назначен Настоятель храма Александра Невского протоиерей Олег Тэор. С 2003 г. церковь окормляло Псковское Духовное училище.
По указу правящего архиерея Митрополита Псковского и Порховского Тихона с 3 июня 2019 г. церковь Святой Великомученницы Варвары является храмом Подворья Псково-Печерского монастыря.